Puchar Polski Kobiet będzie rozgrywany w systemie "przegrywający odpada", w formie pojedynczych meczów w każdej rundzie. Pary wyłaniane są w losowaniu. Do VI rundy włącznie przy rozstawieniu do losowania zastosowane zostanie kryterium geograficzne.
Gospodarzem każdego meczu jest drużyna z niższej ligi lub wyłaniany jest on w losowaniu. Dla czterech najlepszych drużyn zorganizowany zostanie turniej finałowy w formule Final Four. Organizator turnieju zostanie wyłoniony przez Komisję Przyznawania Turniejów Szczebla Centralnego po wyłonieniu czwórki uczestników.
Terminarz rozgrywek, zgłoszeń i losowań:
Faza wstępna (Zespoły 1 Ligi Kobiet i rozgrywek organizowanych przez WZKosz):
Zgłoszenia drużyn spoza BLK i 1 Ligi Kobiet – do 30 września 2013 r. (poniedziałek)
Losowanie I rundy – 1 października 2013 r. (wtorek)
I runda – 30 października 2013 r. (środa)
Losowanie II rundy (z udziałem 16 drużyn) – 31 października (czwartek)
II runda – 13 listopada 2013 r. (środa)
Losowanie III rundy (z udziałem 8 drużyn) – 14 listopada (czwartek)
III runda – 27 listopada 2013 r. (środa)
Losowanie IV rundy (z udziałem 4 drużyn) – 28 listopada (czwartek)
IV runda – 11 grudnia 2013 r. (środa)
2 drużyny awansują do fazy centralnej
Faza centralna (z udziałem zespołów Basket Ligi Kobiet i 2 najlepszych drużyn fazy wstępnej):
Losowanie V rundy (9 drużyn, 1 para i 7 wolny los) – 12 grudnia 2013 r. (czwartek)
V runda – 15 stycznia 2014 r. (środa)
Losowanie VI rundy (8 drużyn) – 16 stycznia 2014 r.
VI runda – 29 stycznia 2014 r. (środa)
Losowanie VII rundy (4 drużyny) – 30 stycznia 2014 r.)
VII runda – 12 lutego 2014 r. (środa)
2 drużyny awansują do turnieju Final Four.
Turniej Final Four:
Przyznanie organizacji turnieju – najpóźniej 20 lutego 2014 roku (czwartek)
7-8 marca 2014 r. (piątek – sobota)
W turnieju finałowym zapewniony udział mają zespoły CCC Polkowice i Wisła Can-Pack Kraków, uczestniczące w rozgrywkach Euroligi.